以阴离子的分离为例说明一下离子色谱的分离过程。
在色谱柱中，填充了无数的离子交换剂作为离子分离的固定相，固定相上吸附了很多阳离子。
充满色谱柱的流动相为某种盐的 溶液，在没有样品进入时，流动相中的阴离子和固定相的阳离子保持平衡。
样品中含有两种待分离阴离子，基中体积较大的A与固定相的正电荷作用力较大，而体积较小的B作用力小。
在样品进入色谱柱后，色谱仪，阴离子A、B与流动相阴离子一同前进，安捷伦气相色谱仪，三种离子不断的交替占据与固定相阳离子相吸的位置；样品阴离子A与正电荷的作用力较大因而移动较慢，而B移动较快，从而实现了分离。
最终，因为流动相阴离子的数量有很大优势，6890型气相色谱仪，所以样品阴离子A、B都分流出色谱柱，对在不同时间流出色谱柱，液相色谱仪，对在不同时间流出色谱柱的样品离子进行检测，就可以知道样品组分的种类与含量。
色谱柱保护三步骤 延长使用寿命
首先，按照要求对样品进行前处理。样品前处理的最后一步必须是过滤或者离心。
其次，使用在线过滤器来保护保护柱和分析柱，免于被样品中或者系统其它部分产生的颗粒物堵塞。再次，如果保护柱对你的应用有意义则使用保护柱来保护分析柱。
最后，在每批样品分析之后，使用强溶剂来冲洗柱子，除去在柱子上的任何强保留物质。
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